LCL构成了生命的形体。蛋白质是生物生命活动的承担者。两者必然有着密切的联系。蛋白质的组成单位是氨基酸，氨基酸的结构简式是一个中心碳原子（C）接一个氨基（-NH2）和一个羧基（-COOH）一个氢（H）再加一个R基团。如果撇开R基不说，氨基酸主要显示了酸的性质。而氨基酸可以组成人体的血红蛋白，因此具有结合氧气的能力。这和LCL可以为EVA驾驶员供氧十分的相似。我们不妨假设LCL的基本组成就是氨基酸，它可以利用LILITH体内的碱基配对得到。而LILITH的ATF被限制，不能自己控制RNA和DNA的工作，于是体内的LCL大量堆积，最后被排出体外，形成了LCL池（见中央教条）。但是那里的LCL已经变质（性状发生了改变，成了深黄色），和灌入EVA插入栓的LCL肯定不是同一物质。就算是同一物质，也是经过了处理的。从第16话真嗣所言我们可以看出EVA具有净化LCL的能力，因此可以看出LCL是可以自我修复的，而它所需要的条件似乎是EVA机体。那么我们的蛋白质呢？氨基酸所具有的性质中只有一点与之非常相似，那就是和轻金属盐的反应（方程式就不写了）。氨基酸和轻金属变质之后只要加水“盐析”就能得到原来的氨基酸，而且同样具有生命活性。之后在加入人的机体就能完成脱水缩合，形成肽链，也就符合了经处理后的LCL又具有了携带氧气（O2）的性质。
那么导致LCL变质的原因又是什么呢？EVA的驾驶环境中是不可能存在轻金属盐的。
可能性1：驾驶仓长期浸泡在LCL的酸性环境里电离生成了相对应的盐。姑且不论驾驶仓使用的是何种金属材料（轻金属？），如果发生类似现象，不只是LCL，怕是真嗣也得跟着一命呜呼（参见人体的铅中毒）。因此LCL受到金属的感染而发生变质是不可能的。
可能性2：驾驶员员呼出的气体中含有能和LCL反应的物质，而且这种物质在均匀的大气中也很常见，因为中央教条里的LCL也发生了同样的转化。那会是什么呢？水（H2O）？二氧化碳（CO2）？可能性比较大的就是二氧化碳（CO2）了。众所周知，氨基酸含有-NH2基团，使得蛋白质呈现酸碱两种性质。CO2是酸性氧化物，能和具有碱性的物质反应并不奇怪。反应后蛋白质失去了携带O2的能力，在“致死的疾病中”体现得犹为完整。
同时人类得到补完放弃肉体时都化为了LCL也就得到了合理的解释。蛋白质组成了人身体的结构。人类化为LCL的时候没有留下头发也是一个明证。
接下来就是密度的问题。在第23话里面我们可以看到丽的眼泪落在了自己的腿上，可以证明水是不溶于LCL的，就算是含有氯化钠也一样（根据相似相溶的原理），把插入栓看作一个大的试管，那么可以说NaCl和LCL发生了萃取反应，LCL的物理性质也并没有因此改变。而作为有机物的蛋白质却出现了矛盾，蛋白质是亲水性物质，和水完全互溶。对此我们不妨参考参考血红蛋白的例子。血红蛋白是不溶于水的，否则血液的组成就无从说起了。因此我们假定LCL也出于同样的机理而能够和水分离（也许是其表面有一层薄膜之类的物质）。而且其密度似乎比水要小得多，否则就不会出现泪水滴下的现象。可是到了后来LCL的密度似乎一下子大了起来，就算是律子的尸体也可以浮在表面。奇怪的地方不止一处，沉淀又要怎么解释呢？在EVA中的很多地方我们都可以看到混浊的LCL是固体悬浮液，而CO2和氨基酸反应生成了一种新的酸，并非其它的固体杂质。让我们再一次假设，一切都是多余的量引起的。从反应方程式看，1mol的CO2和1mol的H2反应生成1mol的碳酸（H2CO3），1mol的碳酸对应1/2mol的氨基酸，一旦CO2的浓度超过LCL的总量，多余的CO2就会以其本身的形态从LCL饱和液中析出，再融合H2O。而H2O在前面的反应中很有可能已经被消耗怠尽，于是CO2以气体的形式悬浮在LCL中，便出现了类似沉淀的现象。因此变性后的LCL实际上是气体悬浮液（汗~~）。同时也解释了为什么中央教条里的LCL没有出现那样的沉淀，CO2的密度小于LCL，散失在了周围的空气中。回到密度上，由于生成物和反应前的物质在化学结构上已经有了差别，其密度的改变也就可以理解了，也顺带说明了出现沉淀的LCL不能携带氧气的原因（真嗣在第16话曾经表达了类似的意思，说明新的LCL并不能维持生命）。
最后不得不说说关于神经链接方面的问题。LCL，全称LINK CONNECTED LIQUID（神经链接液）。起着链接驾驶员和EVA的作用。而在生物的神经传导中起重要作用的就是“递质”。生物兴奋的传导需要生物电的支持，也是EVA需要耗电的原因，EVA中也有证据，某位NERV技术人员说的，见下图。高一生物课本：“突触小体内的突触小泡就将递质放到突触间隙里，使另一个神经元发生兴奋或抑制”，——而递质的主要成分刚好就是氨基酸！
因此综上所述，我认为LCL的基本组成就是蛋白质，而其单位是氨基酸。在第6话中有下面的镜头：初号机受到第5使徒的攻击，LCL沸腾（蛋白质变质），所以律子会说：“LCL紧急排水。”以维持驾驶员的生命。同样的例子在EVA中有很多。其它的各位就请自己去找吧。
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